Probiotiques et antibiotiques : lesquels choisir et comment les prendre ?

Probiotiques et antibiotiques : lesquels choisir et comment les prendre ?

Les antibiotiques sont indispensables pour traiter certaines infections bactériennes. Mais leur action ne se limite pas aux bactéries responsables de l’infection : ils peuvent également modifier temporairement l’équilibre du microbiote intestinal

Publié le 08/09/2026

Les antibiotiques sont indispensables pour traiter certaines infections bactériennes. Mais leur action ne se limite pas aux bactéries responsables de l’infection : ils peuvent également modifier temporairement l’équilibre du microbiote intestinal.

Chez certaines personnes, cette modification peut s’accompagner de troubles digestifs, notamment de diarrhée. C’est dans ce contexte que les probiotiques sont souvent recherchés en pharmacie.

Mais faut-il prendre systématiquement un probiotique avec un antibiotique ? Tous les probiotiques sont-ils adaptés ? Quand faut-il les prendre et pendant combien de temps ?

Le choix d’un probiotique doit avant tout dépendre de la situation, de la souche utilisée et des données disponibles. Il n’existe pas un probiotique unique qui conviendrait à toutes les personnes prenant des antibiotiques.

Pourquoi les antibiotiques peuvent-ils perturber le microbiote ?

Les antibiotiques sont conçus pour agir sur les bactéries responsables de certaines infections. Cependant, leur action peut également affecter une partie des bactéries naturellement présentes dans notre intestin.

Le microbiote intestinal est constitué d’un ensemble très important et très diversifié de microorganismes. Les antibiotiques peuvent modifier temporairement cette communauté, avec des conséquences variables selon la molécule utilisée, la durée du traitement et les caractéristiques de chaque personne.

Cette perturbation peut notamment être associée à des symptômes digestifs tels que :

  • des selles plus molles ou plus fréquentes ;
  • des diarrhées ;
  • des ballonnements ;
  • des douleurs ou un inconfort abdominal ;
  • une modification temporaire des habitudes intestinales.

Ces troubles ne surviennent pas chez toutes les personnes traitées par antibiotiques et leur intensité peut être très variable.

Pourquoi prendre un probiotique pendant ou après un antibiotique ?

Les probiotiques sont étudiés depuis plusieurs années pour leur intérêt potentiel dans différentes situations associées à la prise d’antibiotiques, notamment pour réduire le risque de diarrhée associée aux antibiotiques.

Mais il est important de comprendre que tous les probiotiques ne présentent pas les mêmes propriétés. Les résultats obtenus avec une souche ou une association de souches ne peuvent pas automatiquement être transposés à toutes les références disponibles.

Le choix doit donc être raisonné en fonction du besoin et des données disponibles pour la souche concernée.

Faut-il prendre systématiquement un probiotique avec un antibiotique ?

Non, ce n’est pas systématique.

La prise d’un probiotique peut être envisagée en fonction du contexte et du risque individuel de troubles digestifs. Elle peut notamment être discutée chez une personne ayant déjà présenté une diarrhée lors d’un précédent traitement antibiotique.

Le choix doit également tenir compte de l’antibiotique utilisé, de la durée du traitement, de l’âge et de l’état de santé général.

Chez les personnes fragiles ou présentant certaines pathologies, un avis médical ou pharmaceutique est particulièrement important avant d’utiliser un produit contenant des microorganismes vivants.

Quel probiotique choisir avec des antibiotiques ?

C’est probablement la question la plus importante.

Face à la diversité des produits disponibles, il peut être tentant de choisir celui qui contient le plus de souches ou le plus grand nombre de milliards de microorganismes. Pourtant, ces critères ne suffisent pas à déterminer l’efficacité d’un produit.

Pour choisir un probiotique, plusieurs éléments sont à prendre en compte.

La souche

Les probiotiques ne doivent pas être considérés comme un groupe homogène. Une souche donnée peut présenter des propriétés différentes d’une autre souche appartenant pourtant au même genre ou à la même espèce.

Lorsqu’un bénéfice a été observé dans une étude, celui-ci est généralement associé à une souche précise, ou à une association précise de souches.

Le nom complet de la souche est donc une information importante lorsqu’on choisit un probiotique.

La dose

La quantité de microorganismes est généralement exprimée en UFC, ou unités formant colonie.

Il n’existe cependant pas de dose universelle valable pour tous les probiotiques. Les quantités étudiées peuvent varier selon les souches et les objectifs recherchés.

Un produit contenant davantage de milliards d’UFC n’est donc pas automatiquement plus efficace qu’un produit moins dosé.

Les données disponibles

Lorsqu’il s’agit de choisir un probiotique dans le contexte d’un traitement antibiotique, il est intéressant de privilégier une référence dont la souche ou l’association de souches a été étudiée dans cette situation.

C’est notamment ce qui permet de distinguer une approche fondée sur les données disponibles d’une simple comparaison du nombre de milliards affiché sur les emballages.

Quand commencer un probiotique : pendant ou après l’antibiotique ?

La question du moment de prise revient très souvent au comptoir.

Lorsqu’un probiotique est utilisé en complément d’un traitement antibiotique, certaines références sont proposées pendant le traitement, tandis que d’autres peuvent être utilisées après celui-ci. Les modalités dépendent du produit, de la souche et de l’objectif recherché.

Il n’existe donc pas une règle unique applicable à tous les probiotiques.

Pour les probiotiques bactériens, on recommande généralement de respecter un espacement avec la prise de l’antibiotique, afin de limiter l’exposition directe du probiotique à l’antibiotique. La durée d’espacement peut dépendre du produit et des recommandations de son fabricant.

Certaines levures probiotiques ne sont pas affectées de la même manière par les antibiotiques, ce qui constitue une différence importante entre les différentes catégories de probiotiques.

Le plus simple est donc de suivre les recommandations figurant sur le produit et les conseils de votre pharmacien.

Combien de temps prendre un probiotique ?

La durée d’utilisation dépend là encore du produit et de l’objectif recherché.

Dans le contexte d’un traitement antibiotique, certaines références sont utilisées pendant la durée du traitement, éventuellement avec une poursuite après celui-ci. Mais cette durée ne peut pas être généralisée à tous les probiotiques.

Il est donc préférable de respecter les recommandations propres à la référence choisie plutôt que de considérer qu’une durée unique convient à tous les produits.

Peut-on prendre un probiotique en même temps que son antibiotique ?

Cette question mérite une précision.

Pour certains probiotiques bactériens, il est généralement préférable de ne pas prendre les deux produits exactement au même moment. Un espacement permet de limiter le contact direct entre l’antibiotique et les bactéries probiotiques.

En pratique, le pharmacien peut vous indiquer comment organiser les prises en fonction de l’antibiotique et du probiotique utilisés.

Il ne faut en revanche jamais modifier la dose ou la fréquence de l’antibiotique pour pouvoir prendre un probiotique.

Les erreurs à éviter

Choisir uniquement en fonction du nombre de milliards

Un nombre élevé d’UFC peut sembler rassurant, mais il ne permet pas à lui seul de juger de l’intérêt d’un probiotique.

Pensez que tous les probiotiques ont le même effet

Les propriétés des probiotiques sont liées aux microorganismes et aux souches utilisés. Un résultat obtenu avec une souche ne signifie pas nécessairement qu’une autre souche aura le même effet.

Prendre n’importe quel produit « pour la flore intestinale »

La formulation d’un produit doit correspondre au besoin recherché. Une référence destinée au confort digestif général n’est pas nécessairement celle qui a été étudiée dans le contexte spécifique d’une prise d’antibiotiques.

Arrêter ou modifier son antibiotique

Un probiotique ne diminue pas la nécessité de suivre correctement le traitement antibiotique prescrit. Il ne faut jamais interrompre ou modifier un traitement antibiotique de sa propre initiative.

Que faire en cas de diarrhée pendant un traitement antibiotique ?

Une diarrhée pendant ou après un traitement antibiotique peut être liée à une modification du microbiote, mais toutes les diarrhées sous antibiotiques ne sont pas bénignes.

Il est important de surveiller l’évolution des symptômes et de rester particulièrement attentif à certains signes : diarrhée importante ou persistante, fièvre, douleurs abdominales importantes, sang dans les selles ou signes de déshydratation.

Dans ces situations, une consultation médicale est nécessaire.

Une diarrhée importante apparaissant pendant ou après un traitement antibiotique peut notamment nécessiter de rechercher une infection à Clostridioides difficile. Il ne faut donc pas systématiquement considérer toute diarrhée comme un simple effet secondaire sans gravité.

À lire également : Diarrhée : quand faut-il consulter et que peut-on faire ?

Antibiotiques et probiotiques : le conseil de votre pharmacien

Lorsqu’un patient vient chercher un antibiotique, la question du probiotique peut être abordée au cas par cas.

Le pharmacien peut notamment aider à vérifier :

  • le type d’antibiotique utilisé ;
  • la durée prévue du traitement ;
  • les antécédents de troubles digestifs liés aux antibiotiques ;
  • l’âge et la situation particulière du patient ;
  • la souche ou les souches présentes dans le probiotique ;
  • la dose recommandée ;
  • le moment approprié pour la prise ;
  • la durée d’utilisation.

Cette approche permet de ne pas choisir un probiotique simplement parce qu’il contient « beaucoup de bactéries », mais de rechercher une référence cohérente avec la situation.

Probiotiques et antibiotiques : ce qu’il faut retenir

  • Les antibiotiques peuvent modifier temporairement le microbiote intestinal et provoquer des troubles digestifs chez certaines personnes.
  • Les probiotiques ont été étudiés notamment pour leur intérêt dans la prévention de la diarrhée associée aux antibiotiques.
  • Tous les probiotiques ne sont pas équivalents.
  • Le choix doit notamment tenir compte de la souche, de la dose et des données disponibles.
  • Un nombre élevé d’UFC ne signifie pas automatiquement qu’un produit sera plus efficace.
  • Pour les probiotiques bactériens, un espacement avec l’antibiotique peut être recommandé.
  • Les modalités de prise et la durée d’utilisation dépendent du produit choisi.
  • Un probiotique ne remplace jamais l’antibiotique et ne doit pas conduire à modifier le traitement prescrit.
  • En cas de diarrhée importante, persistante ou accompagnée de signes d’alerte, un avis médical est nécessaire.

Vous souhaitez en savoir plus sur les probiotiques ? Retrouvez également notre guide général Probiotiques : comment choisir le bon probiotique selon ses besoins ?, ainsi que nos prochains articles consacrés aux différents besoins digestifs.

Envoi d’ordonnance
Envoyer mon ordonnance
Vous avez une ordonnance ?
Commandez l’article et joignez votre ordonnance.

 
J’envoie mon ordonnance
Newsletter
Découvrez nos offres, nouveautés et conseils en vous abonnant à notre newsletter ! C’est gratuit, sans engagement et vous pouvez vous désinscrire à tout moment.
Livraison offerte
Livraison offerte
en Point Relais
à partir de 79 (jusqu’à 10kg)

Expédition
sous 24 à 48h
(si article en stock)

Carte de fidélité
parapharmacie

Prix bas
toute l’année
Paiement sécurisé
Paiement
sécurisé

Nombreux
modes
de paiement
Paiment sécurisé
Professionnels
mandat administratif
accepté